本学科环境科学专业于1979年经国家教委批准成立。1986年建立了环境化学硕士点。1987年环境科学系成立。1994年环境分析化学方向招收博士生（属分析化学博士点），1996年建立环境化学博士点，1998年建立环境科学博士点，1999年环境科学系更名为环境科学与工程系。2002年被确定为吉林省高等学校重点学科。

经过20多年的努力，吉林大学环境科学学科在国内同类学科中已具有较高的学术地位和一定的重要影响，教学、科研和人才培养在国内同类学科中位于前列，以形成若干稳定的研究方向， 主要学术带头人有董德明教授、汤洁教授、马小凡教授，主要研究方向有三个：

1、环境化学。在环境污染物的富集分离及分析方法方面，根据我国国情，研制和开发系列大气无动力采样器，其中SO2、NO2检测器填补了国内空白；对在线流动注射分离富集技术与原子吸收、原子发射和原子吸收光谱法的联用体系进行研究，建立了这些联用技术测定环境污染物的分析方法。水环境中重金属形态分析方法方面取得了突破性的进展，某些方面的研究成果已处于国际领先水平。在环境光化学领域，模拟研究了水和大气环境中主要污染物的光化学行为，研究了水、气环境中污染物的光催化治理技术，在基础理论和应用方面有非常重要的意义，这些研究成果处于国内领先地位，某些成果已达到国际先进水平。在环境中重金属迁移转化研究领域，重点研究了水环境中生物膜去除有毒重金属机制以及铝在土壤环境中迁移转化及环境毒性作用机制，一些成果也处于国际领先水平。

2、环境评价规划。结合我国环境保护目标，系统研究了水资源核算及其纳入国民经济核算体系、环境影响评价公众参与的社会学基础、环境价值理论、污染物总量控制的质量平衡理论以及模糊论在环境中的应用，其成果处于国内领先水平。

3、生态环境系统工程。开展生态环境与国民经济协调发展、资源合理开发利用、农业生态环境治理、生态环境恢复的研究。为合理开发综合利用水、土、生物资源，保护治理生态环境，维护生态平衡，促进社会经济可持续发展提供决策、方案和措施。提出了二次沙化、二次碱化的新观点，指出了研究防治荒漠化的关键；建立了干旱半干旱生态环境质量评价的指标体系，进行了典型区的综合评价，为保护生态环境、合理利用资源提出了理论依据。首次开发了GIS与EIS耦合技术，并将其应用于生态环境研究、恢复和治理工程中，提出了城市固废地质填埋处理新理论和新方法，建立了包气带地下水污染模拟模型。这些成果均处于国内先进水平。

本学科现有教授4人，副教授8人，有博士学位的教师占70.4%。教师中1人入选"教育部跨世纪优秀人才资助计划"和"教育部高等学校骨干教师资助计划"。

近10年来，本学科完成国家自然科学基金、国家部委及地方横向科研课题近150项，出版学术专著20余部，发表学术论文450余篇。

本学科十分重视国际交流与合作，先后有20余人次到英国、加拿大、美国、日本、德国、瑞典等国讲学、进修获攻读学位。外国专家学者多次来系讲学或开展合作研究。