基本概况
作物遗传育种二级学科硕士点隶属于作物学一级学科, 1992年与外校联合培养硕士研究生，1997年被国家批准为硕士学位授权学科，“十五”期间被军队总后勤部评为重点学科，2006年被确认为吉林省高等学校省级重点学科。
经多年建设，本学科已形成了一批由30余名教授、副教授、青年博士为主体的、结构合理的高水平学术梯队。其中教授7人,副教授8人,讲师15人,助教2人，现有硕士生导师9人,博士生导师3人,具有博士学位12人,在读博士学位2人,具有硕士学位16人,在读硕士学位2人。本学科“十五”以来共承担国家自然科学基金、教育部、总后军需部、吉林省科技厅等科研课题30余项，获省级科技进步一等奖1项，省级科技进步二等奖2项，军队科技进步二等奖2项，国家级教学成果奖1项，吉林省登记科技成果6项,国家登记科技成果2项,发明专利1项。主编和参编著作6部，在省级以上学术杂志发表论文200余篇,其中被SCI收录30余篇，为该学科的建设发展做出了贡献。
作物遗传育种二级学科的优势是教师队伍的年轻化,发展的空间大，以突出生命科学、生物信息学和生物技术等新兴学科与遗传育种的交叉与融合为研究特色,坚持以培养社会需要的复合型人才为目标。现拥有总面积为1000余平方米的5个专业实验室，总值700余万元的大型仪器设备，具备了使该学科持续发展的科研实力和科研环境。

主要研究方向
1.作物种质资源发掘及利用
学术带头人：王庆钰教授
学术团队：都兴林教授、崔金虎教授、田佩占教授、李景文讲师、王洪预讲师、王晶莹讲师
植物种质资源与利用研究方向主要进行作物杂种优势的遗传机理研究；作物高产、优质、多抗新品种选育；作物种质资源筛选及利用的研究，不断为植物育种、生物技术和农业生产提供新的有利用价值的优异资源，这将为农业科学研究奠定理论基础和提供物质保障。
该研究方向累计承担国家及省部级科研课题30项，先后获得省部级奖励8项，获省审批推广品种3个，培养硕士研究生50余名，共发表论文100余篇，其中被SCI收录10余篇。其中野大麦和牧草的研究成果已应用于我国西部地区生态环境的建设，水稻、玉米、大豆、小麦、向日葵、园艺植物、野菜等研究成果为种质资源的利用提供了新材料、新技术和新方法。
2.分子标记及其基因定位
学术带头人：原亚萍教授
学术团队：李彦舫教授、马兰青副教授、类淑霞副教授、李世鹏讲师、张明哲讲师
本研究方向运用分子生物学的先进技术，将目的基因直接或通过载体导入受体细胞，使遗传物质重新组合，新的基因在受体细胞中表达，最后从转化细胞中筛选有价值的新类型。?
本研究方向先后承担了吉林省玉米新品种标准DNA指纹数据库的建立研究、大麦a-淀粉酶抑制基因对小麦a-淀粉酶抑制作用研究、小麦穗发芽抗性机理的研究、玉米杂交种“军单8号”的选育及推广、玉米“吉糯1号”的选育及推广、超甜型甜玉米单交种“吉甜6号”、高油玉米“通油1号”的选育及推广应用等课题。曾获吉林省科学技术进步二等奖1项，吉林省科学技术进步三等奖3项，吉林省登记科技成果3项。编著5部，发表论文100余篇，其中被SCI收录10余篇。培养硕士研究生50余名。
3.作物育种遗传改良
学术带头人：杨振明教授
学术团队：闫飞副教授，鞠会艳副教授，尤江峰讲师，曹宁讲师等
多年来该方向在国家自然科学基金、教育部留学归国基金和日本生研机构等资助下，主要从事高等植物抗逆（低钾、铝毒）的生理生化及分子生物学机制研究，尤其对铝毒逆境胁迫下大豆的逆境响应特征、机理等方面作了较为深入系统的研究，并在国际上首次提出了大豆的主要耐铝机制之一是通过分泌大量柠檬酸来络合铝离子。目前，正进一步从细胞、分子水平对铝毒逆境胁迫下的信号传导、表达机制等方面进行研究，试图综合揭示植物适应养分亏缺、金属离子毒害等逆境的本质，确定调节的关键因子，从而最大限度地挖掘植物自身的生物学潜力，为利用基因工程方法培育作物抗逆高效品种和改进抗逆高效的栽培措施、大幅度提高作物产量和养分利用效率提供理论和策略。

本方向自2000年以来，主持国家自然科学基金课题2项、“十一五”支撑计划子课题1项，教育部留学归国基金、企业横向课题等各1项，以及省部级课题4项等，获黑龙江省科学技术进步二等奖1项。发表学术论文50余篇，其中SCI收录18篇。

“十五”期间学科建设成效
科学研究：近年来，本学科以东北地区重要农作物及园艺植物为研究对象，将传统的作物遗传育种及植物营养等方面的研究手段与细胞学、生物化学和分子生物学技术结合起来进行了系统的研究工作，取得了一系列进展，明显地提高了本学科整体研究水平。在甜玉米杂交种选育、高油玉米的培育、水稻优质新品种的选育及推广、油用向日葵杂交种的选育、作物高产高效技术平台的构建等方面获得了多项省及军队科技进步奖，并取得了显著的经济效益和社会效益，为促进我国农业生产的可持续发展做出了突出的贡献。共承担国家自然科学基金、教育部、总后军需部、吉林省科技厅等科研课题20余项，获省级科技进步一等奖1项，省级科技进步二等奖2项，军队科技进步二等奖2项，国家级教学成果奖1项，吉林省登记科技成果2项，国家登记科技成果2项，发明专利1项。主编和参编著作6部，在省级以上学术杂志发表论文200余篇，其中被SCI收录20篇。
队伍建设：“十五”期间本学科非常重视师资队伍在学科建设和发展中的核心地位。坚持“以人为本”的指导思想，充分发挥综合优势，吸引国内外优秀人才。想方设法改善学术骨干的工作和科研条件，吸引和稳定了一大批国内外优秀年轻人才，为学科的可持续发展奠定了良好基础。鼓励学科中青年骨干力量报考在职定向博士研究生，已有多人学成回校，成为学科教学科研的中坚力量。经过几年的努力，学科师资队伍在数量上有了较大发展，质量有了较大提高，一批新的学科带头人和学术骨干已经成长起来，教师的职务、学历、年龄结构明显改善，学科梯队建设取得显著进展，学术带头人队伍不断扩大，有力地推动了学科教学、科研、管理等各项工作。科研和学术水平不断迈上新台阶，科研项目特别是大项目明显增加，科研经费大幅增长，高水平的SCI论文逐年增多。
人才培养：已毕业博士17人，已毕业硕士33人，现有在读博士9人、在读硕士39人。毕业的硕士研究生有多人考入中国科学院、军事医学科学院、清华大学等单位攻读博士学位，有的已经成为高校和科研单位的中青年骨干。
学术交流：本学科特别重视各种方式的国内外学术交流与合作。1998年筹办了全国植物学会;在教育部访问学者基金及吉林大学农学部的资助下，前来进行学术交流的有国内外高级访问学者、国内学者（其中包括国内院士、长江学者），参与国际合作和派出访问学者，参加国际会议和双边会议，并与香港中文大学和中国农业大学合作，开展了多方课题研究，并发表多篇SCI收录论文。
条件建设： 在吉林大学农学部的大力支持下，作物遗传育种学科设有遗传育种实验室、组织培养室、农业资源与环境实验室、基因工程研究中心。本学科有相对集中的教学科研用房1000余平方米，拥有万元以上仪器设备190台，能够满足本科生、硕士研究生、博士研究生的教学和科研需要。

“十一五”期间学科建设目标
“十一五”期间将从国家经济建设的实际需要出发，围绕作物种质资源的发掘研究利用及新品种选育、分子标记及其基因定位、植物营养遗传改良三个主要研究方向，进一步完善和优化梯队建设，扩大研究生规模，严把培养质量关，改善科研和教学条件，加强管理体系建设。力争1个研究方向达到国内先进水平，部分研究成果达到国际领先水平，使本学科成为推动我国作物遗传育种学科和农业可持续发展的主要力量。